Page 45 - tmp
P. 45

Analiza ekspresije proteina β-aktina u tkivima i embrionima zebrice (Danio rerio)


                                                        Ana Sarić
                                   Regionlni Centar za Talente Beograd II, anasaric29@gmail.com





                                                               zebrice, 30µL, 5. proteini izolovani iz srca zebrice, 20µL,,
          1. Uvod                                              6.  proteini  izolovani  iz  srca  zebrice,  10µL,,  7.  Marker,  8.
                                                               proteini  izolovani  iz  skeletnog  mišiča  zebrice  5µL,  9.
          Za  shvatanje  bilo  kog  organizma  potrebno  je  razumeti   proteini  izolovani  iz  skeletnog  mišiča  zebrice  10µL,  10.
          unutrašnje  stanje  ćelije  u  različitim  fazama  njegovog   proteini izolovani iz skeletnog mišiča zebrice 20µL.
          razvića.  Da  je  to  moguće  potrebno  je  pratiti  aktivnost  i
          regulaciju sinteze proteina.
                                                               4. Rezultati istraživanja
          Zebrica (Danio rerio) se sve češće koristi kao model sistem
          za proučavanje toksičnosti različitih materija, potencijalnog   Aktin je detektovan u svim nanetim uzorcima u različitim
          dejstva  novih  lekova,  ali  i  za  izučavanje  bolesti  čoveka.   količinama.  U  zavisnosti  od  količine  nanetog  uzorka  i
          Aktin, protein čija je ekspresija praćena u ovom radu, nalazi   količine proteina  u  njima detektovane trake  su  slabijeg ili
          se  u  svim  eukariotskim  ćelijama  jer  on,  pored  svojih   jačeg intenziteta.
          mnogobrojnih funkcija, učestvuje i u izgradnji citoskeleta.
          Kod čoveka ovaj protein nalazi se u šest oblika od kojih je
          jedan i β-aktin. Iako protein zebrice nije identičan proteinu
          čoveka sličnost među njima je značajna što nas dovodi do        Slika 1 – Izgled filma nakon detekcije
          mogućnosti da antitelo napravljeno za humani β-aktin može
          da detektuje i aktin zebrice.                        U  nanetim  uzorcima  srca  zebrice  ima  manje  ukupnih
                                                               proteina nego u uzorcima mišića zbog čega su detektovane
           2. Cilj rada                                        trake slabije. U uzorku srca zebrice gde je količina proteina
                                                               bila najmanja (6) nije detektovana traka zbog male količine
                                                               nanetog uzorka.
          Cilj  ovog  istraživanja  bio  je  da  se  proveri  da  li  antitelo   Razlika u dužini trake pozitivne kontrole (uzorku humanog
          napravljeno za humani β-aktin radi i na proteinu zebrice i   proteina)  i  ostalih  uzoraka  može  se  pripisati  razlici  u
          da  li  ono  može  da  se  koristi  u  daljim  eksperimentima  za   veličini proteina, nepotpunoj denaturaciji ili nekim drugim
          procenu količine proteina nanetih na gel.
                                                               faktorima,  ali  ona  nije  značajna  za  ovo  istraživanje  i  ne
                                                               utiče na njegove rezultate.
          3. Metoda rada
                                                               5. Zaključak
          Jedna  od  metoda  koja  se  koristi  za  praćenje  ekspresije
          proteina  je  Western  blotting  metoda.  Uzorci  ukupnih   Primenom  Western  Blotting  metodologije  u  ovom  radu
          proteina su  izolovani iz tkiva srca i skeletnog mišića , kao i   pokazano  je  da    antitelo  koje  je  napravljeno  za  humani
          iz  celih  embriona  zebrice.  Nakon  toga  uzorci  su   protein  β-aktin  detektuje  i  aktin  u  tkivima  i  embrionima
          denaturisani   i   razdvojeni   elektroforezom   u   SDS   zebrice,  tako  da  se  može  uspešno  koristiti  u  daljim
          poliakrilamidnom  gelu,  pa  prebačeni  na  membranu.  Posle   eksperimentima.  Ovakvi  rezultati  su  dobijeni  zbog
          transfera  membrana  je  ostavljena  u  PBS  puferu  sa  0,01%   evolutivne  očuvanosti  tj  sličnosti  aktina  između  čoveka  i
          Tween-om  i  10%  mlekom  u  prahu  preko  noći,  čime  se   zebrice.
          sprečava  nespecifično  vezivanje  antitela  za  proteine  na
          membrani.  Nakon  toga  je  dodato  primarno  antitelo  za  β-
          aktin koje se vezuje za specifična mesta u proteinu, a posle   LITERATURA
          pranja  i  sekundarno  antitelo  koje  se  vezuje  za  primarno  i
          sadrži  „boju“  koja  nam  omogućava  detekciju.  Uzorci  su   [1] Perrin B, Ervasti J. The Actin Gene Family: Function
          detektovani ECL supstratom na filmu.                 Follows Isoform Cytoskeleton,2010; 67:630–634.
          Uzorci  su  nanošeni  na  gel  u  različitim  koncentracijama.   [2] Towbin  H,  Staehelint  T,  Gordon  J. Electrophoretic
          Njihov redosled na membrani (i gelu) bio je: 1. pozitivna   transfer    of    proteins    frompolyacrylamide  gels  to
          kontrola, 2. proteini izolovani iz embriona 30µL, 3. proteini   nitrocellulose  sheets:  Procedure  and  some  applications
          izolovani  iz  embriona  50µL,  4.  proteini  izolovani  iz  srca   Proc.Natl. Acad. Sci. USA 1979; 76(9):4350-4354
   40   41   42   43   44   45   46   47   48   49   50